Сучасний стан та перспективи діагностики захворювань легень, спричинених нетуберкульозними мікобактеріями

O.A. Zhurilo; A.I. Barbova

doi:10.30978/TB2019-1-73

Автор(и)

O.A. Zhurilo ДУ «Національний інститут фтизіатрії і пульмонології імені Ф.Г. Яновського НАМН України», Київ, Україна
A.I. Barbova ДУ «Національний інститут фтизіатрії і пульмонології імені Ф.Г. Яновського НАМН України», Київ, Україна

DOI:

https://doi.org/10.30978/TB2019-1-73

Ключові слова:

мікобактеріоз, нетуберкульозні мікобактерії, фенотипова діагностика, генотипова діагностика

Анотація

Нині в світі впроваджують у практику різноманітні схеми фенотипової і генотипової діагностики M. tuberculosis та нетуберкульозних мікобактерій, які є збудниками мікобактеріозів. Це потрібно для того, щоб максимально скоротити терміни ідентифікації мікобактерій. Використання цих методів дає змогу дістати повнішу інформацію щодо збудника туберкульозу і мікобактеріозів у разі захворювання з невеликим бактеріовиділенням.
Мета роботи — оцінка ситуації щодо поширення захворювань на мікобактеріоз та аналіз перспектив фено- і генотипової діагностики цих захворювань.
У літературному огляді наведено відомості про збудників мікобактеріозів — нетуберкульозних мікобактерій. Схарактеризовано різні підходи до їхньої класифікації. Викладено сучасні методи виявлення і ідентифікації нетуберкульозних мікобактерій, проведено оцінку їхньої ефективності. Великої уваги надано методам генотипової діагностики мікобактеріозів. Аналіз основних наукових джерел свідчить, що актуальною проблемою сьогодення є прогресуюче збільшення захворюваності на мікобактеріози. Лабораторна діагностика їхніх збудників ускладнена.

Висновки. На сьогодні мікобактеріози є серйозною проблемою як для лікарів-клініцистів, так і для фахівців лабораторної служби. Значна різноманітність збудників, складнощі з проведенням преаналітичного етапу, неоднозначність методів мікроскопічного дослідження і культивування, впровадження в практику принципово нових методів ідентифікації вимагають розробки нормативних документів, що регламентують алгоритми лабораторної діагностики і ідентифікації етіологічно значущих нетуберкульозних мікобактерій. Особливо гостро це питання стоїть у зв’язку зі значним зростанням захворюваності на ВІЛ-інфекцію і збільшенням кількості пацієнтів з виразними імунодефіцитами.

Біографії авторів

O.A. Zhurilo, ДУ «Національний інститут фтизіатрії і пульмонології імені Ф.Г. Яновського НАМН України», Київ

Журило Олександр Анатолійович

д. мед. н., зав. лабораторії мікробіології і біохімії

03038, м. Київ, вул. М. Амосова, 10

A.I. Barbova, ДУ «Національний інститут фтизіатрії і пульмонології імені Ф.Г. Яновського НАМН України», Київ

Бардова Катерина Олексіївна

к. мед. н., доц. кафедри дерматовенерології

Посилання

Alchovik OI, Dimova MA, Cherednichenko AG. Rasprostranennost netuberculosnich mycobaceriy v Sibiry [Prevalence of non-tuberculosis mycobacteria in Siberia] (Rus). Probl Med Micologii [Probl Med Mycology] (Rus). 2016;18 (2):37.

Golishevskaya VI, Sevastaynova EV. Sovremennoe sostoyanie microbiologicheskoy diagnostiki tuberculosa v Rosssi [The modern state of microbiological diagnostics of tuberculosis in Russia] (Rus). Aktualnie problemi tuberculosa i bolesni logkich [Issues of the day of tuberculosis and illnesses of lungs] (Rus). M. 2006: 17-18.

Dolgova VV, Menchikova VV. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika: nacionalnoe rukovodstvo [Clinical laboratory diagnostics: national guidance] (Rus). M. GOETAR-Media; 2013:808.

Eliseev PI. Rol molecularno-geneticheskich metodov Genotype v povishenii efektivnosti diagnostiki tuberculosa s lekarstvenoiy ustoyichivostu mycobacteriy i micobacteriosov: avtoref. dis. …kand. med. nauk. [Role of molecular-genetic methods of Genotype in the increase of efficiency of diagnostics of tuberculosis with medicinal stability of mycobacteria and mycobackteriosis: abstr. dis…cand. med. sciences] (Rus) GBOU VPO Severniy gos med Univer MZ Rossi [North state medical university Min. of health protection of Russia] (Rus). SPb: 2013:23.

Erochin VV, Golishevskaya VI, Shulgina MV. Kulturalnie metodi diagnostiki tuberculosa: uch. pos. [Bacteriological methods of diagnostics of tuberculosis: train aid] (Rus). M.-Tver.ООО Izdatelstvo Triada [M.-Tver: Publishing house Triada] (Rus). 2008:208.

Labinskaya AS, Kostukova NN. Oportunisticheskie infekcii: vozbuditeli i etiologicheskay diagnostika [Opportunistic infections: causative agents and etiologic diagnostics]. М. Binom; 2013:752.

Litvinov VI, Makarova MV, Krasnova MA. Netuberculosnie mycobacerii [Non-tuberculosis mycobacteria] (Rus). М. MNPCBT; 2008:256.

Lopakov KV, Sabgaida TP, Popov SA. Noviy integralniy pokasatel «epudemiologicheskiy potencial tuberculosa» [A new integral index is «epidemiology potential of tuberculosis»] (Rus). Socialnie aspect zdorovia naselenia [Social aspects of health of population] (Rus). 2009;1: URL:http://vestnik.mednet.ru/content/view/105/30/lang.ru.

Mayorova AA. Idetifikacia netuberculosnich mycobaceriї avibor optimalnoy kombinacii metodov dla ich vidovoy differenciacii: avtoref. dis…knd. boil. nauk. [Idenntication of non-tuberculosis mycobacteria and choice of optimal combination of methods for their specific differentiation: abstr. dis…cand. boil. sciences] (Rus). FGUZ «Moscovskiy nauchno-issledovatelsky insititut epidemiologii i microbiologii im. GN Gabrichevskogo» Rospotrebnadzora RF [Moscow research institute of epidemiology and microbiology the name of GN Gabrichevskogo Rospotrebnadzora RF] (Rus). M. 2007:26.

Otten TF, Vasilev AV. Mikobakterios [Mycobacteriosis]. SPb: Medicinskaay presa [The medical press] (Rus). 2005:218.

Perelman MI. Tuberculos [Tuberculosis]. M. 2003:233.

Sevastayanova EV, Golishevskaya VI. Viavlenie tuberculosa metodom mikroskopii [Exposure of tuberculosis the method of microscopy] (Rus). Uch. Piosobpie [Train aid] (Rus). M.-Tver: ООО Izdatelstvo «Triada» [M.-Tver: Publishing house «Triada»] (Rus). 2008:100.

Ergeshov A. Netuberculosnie mycobaceriї u patientov s zabolevaniami organov dichania (kliniko-laboratornoe issledovanie) [Non-tuberculosis of mycobacteria for patients with the diseases of breathing organs (research)] (Rus). Pulmonologia [Pulmonology] (Rus). 2016;26(3):303-308.

Adekambi Т. RpoB gene sequence-based characterization of emerging non-tuberculous mycobacteria with descriptions of Mycobacterium bolletii sp. nov., Mycobacterium phocaicum sp. nov.and Mycobacterium aubagnense sp. Nov Int J Syst Evol Micr.2006;56:133-143. doi: 10.1099/ijs.0.63969-0.

Daley CL, Griffith DE. Pulmonary non-tuberculous mycobacterial infections. Int J Tuberc Lung Dis. 2010;14(6):665-671.

Euzebi J. List of bacterial names with standing in nomenclature. Genus Mycobacterium. 2003;12.

Field SK, Cowie RL. Lung disease due to the more common nontuberculous mycobacteria. Chest. 2006;129:1653-1672. doi: https://doi.org/10.1378/chest.129.6.1653.

Field SK, Fisher D, Cowie RL. Mycobacterium avium complex pulmonary disease in patients without HIV infection. Chest. 2004;126:566-581. doi: https://doi.org/10.1378/chest.126.2.566.

Griffith DE. An official ATS/IDSA statement: diagnosis, treatment, and prevention of nontuberculous mycobacterial diseases. Am J Respir Crit Care Med. 2007;175:367-416. doi: https://doi.org/10.1164/rccm.200604-571ST.

Griffith DE, Aksamit T, Brown-Eliot BA. An official ATS IDSA statement: diagnosis, treatment, and prevention of nontuberculous mycobacterial disease. Am J Respir Crit Care Med. 2007;175:367-416. doi: https://doi.org/10.1164/rccm.200604-571ST.

Hall L, Doerr K, Wohlfiel S, et al. Evaluation of the MicroSeq system for identification of mycobacteria by 16S ribosomal DNA sequencing and its integration into a routine clinical mycobacteriology laboratory. J Clin Microbiol. 2003;41;1447-1453. doi: 10.1128/JCM.41.4.1447-1453.2003.

Heifets L. Mycobacterial infections caused by nontubercilous mycobacteria. Semin Respir Crit Care Med. 2004;25(3):283-295. doi: 10.1055/s-2004-829501.

Huitt GA, Daley CL. Clinic in chest medicine. Nontuberculous mycobacteria. Elsevier. 2015;36(1);125. doi: https://doi.org/10.1016/j.ccm.2014.11.006.

Katoch V. Infectionsdue to nontuberculous mycobacteria (NTM). Indian J Med Res. 2004;120:290-304.

Marras TK. Isolation prevalence of pulmonary non-tuberculous mycobacteria in Ontario, 1997-2003. Thorax. 2007;62:661-666. Doi: http://dx.doi.org/10.1136/thx.2006.070797.

Marras TK, Daley CL. Epidemiology of human pulmonary infection with nontuberculous mycobacteria. Clin. Chest.Med. 2003;23:553-567. doi: https://doi.org/10.1016/S0272-5231(02)00019-9.

Mase SR, Ramsay A. Yield of serial sputum specimen examinations in the diagnosis of pulmonary tuberculosis: a systematic review. Int J Tuberc Lung Dis. 2007;11:485-495.

McNabb AD Assessment of partial sequencing of the 65-kilodalton heat shock protein gene (hsp65) for routine identification of mycobacterium species isolated from clinical sources. J Clin Microbiol. 2004;42:3000-3011. doi: 10.1128/JCM.42.7.3000-3011.2004.

Pye A, Hili SL, Bharadwa P. Effect of storage and postage on recovery and quantization of bacteria in sputum samples. J Clin Pathol. 2008;61:352. doi: http://dx.doi.org/10.1136/jcp.2007.051490.

Tortoli E. Impact of genotypic studies on mycobacterial taxonomy: the new mycobacteria of the 1990’s. J Clin Microbiol Rev. 2003;2:319-354. doi: 10.1128/CMR.16.2.319-354.2003.

Tortoli E, Rindi L, Garcia MJ, et al. Proposal to elevate the genetic variant MAC-A, included in the Mycobacterium avium complex, to species rank as Mycobacterium chimaera sp. nov. J Syst Evol Micr. 2004;54:1277-1285. doi: https://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.02777-0.